Re: 進捗とstaden package (Knob-dev 7) - KNOB

マホレックスの南島です。

> リアクションが遅くてすみません。

いえ、こちらこそ仕事が遅くてすみません。。

> Clone.pm, BLAST の件は了解しました。ありがとうございました。
> 
> Standen package はちょっと hack してみないとわからないですね。
> まず、Knoppix から離れて standen をいじってみます。
> 今回のリリースは少し時間をかけてたいと思います。
> 
> まず、毎回のテストをスプリクト化するなど、システマティックな方法を
> 考えたいと思います。

よろしくお願いします。
自分も時間をみつけていじくってみようと思います。


> また、置き場所のポリシーも議論しましょう。
> /ramdisk or /home/knoppix かは、どうしますかね。
> EMBOSS との統一性をみれば、/ramdisk でしょうか。Knoppix では、
> /home/knoppix に置くという作法があるのであれば、それでも構いません。
> ほかの Knoppix base のものはどうしているかも調べたほうが良いかも
> しれません。

他を見てないので例があるかどうかはわからないのですが、
/ramdisk に置くのも /home/knoppixに置くのもあまりないのではないでしょう
か。
ただ、仮にいくつか例があるとすれば、/home/knoppixの方が多いのではないか
と思います。
OpenOffeceのように/optもありますね。
ちなみに、仕事的にはほとんど違いはないです。
個人的には、staden の仕様に左右されるかなと思っています。
個人用のデータのwriteがあるとしたら/homeの方が良いかなと。
でもREADMEに従うとしたら/usr/local/stadenですか。
いや、/usr/localの場合は/usr/local/staden_linuxにした方が良いですね。
READMEはそうですし。

・・なんかREADMEに従った方が良い気がしてきました。


> このまえ、片山さん@BioRuby が会いにきてくれたのですが、BioRuby の 1.8.1
> への対応状況を聞いておきました。PubMed 関係の library に少し修正が必要と
> のことで、CVS には修正版があるそうです。KNOB のリリースにあわせて、それ
> らをパッケージングしなおして、1.5.4 を出せるかも、ということでしたが、少
> し時間がかかりそうです。

了解しました。
間に合ってくれるとうれしいです。
 
> あと、坊農さんがバイオベンチャーで連載中のバイオインフォマティクスの記事
> で KNOB をしてくれるそうです。

それは心強いですね。
楽しみにしています。

KNOB

[Knob-dev 7] Re: 進捗とstaden package