Nagano
nagano_imcj****@syd*****
2005年 6月 10日 (金) 20:27:36 JST
長野です
以下のプログラム、「ecmapper.rb」をKNOB1.3.2上で実行すると
#!/usr/bin/env ruby
require 'bio'
serv = Bio::KEGG::API.new
pathways = serv.mark_all_pathways_by_enzymes('hsa',['ec:1.1.1.1'])
pathways.each do |url|
p url
end
次のようなエラーメッセージが出ます。プログラム上のミスでしょうか、それともバージョン等が変わって設定インデックス名などが変わっているからでしょうか。
> ruby ecmapper.rb
/usr/local/lib/site_ruby/1.8/bio/io/keggapi.rb:44:in
`send': undefined method `mark_all_pathways_by_enzymes'
for #<SOAP::WSDLDriver:{SOAP/KEGG}KEGGPort>
(NoMethodError)
from /usr/local/lib/site_ruby/1.8/bio/io/keggapi.rb:44:in
`method_missing'
from ecmapper.rb:6
宜しくコメントお願い致します。
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