Re: KEGG API　使用時のエラー (Knob-friends 20) - KNOB

  二階堂さん

  長野です

  [Knob-friends 17] [Knob-friends 18] 何れのプログラムもご指摘頂いた箇所を加える事で、必要な情報が得られました。

  まだ、使用法が理解で来ていない部分もあり失礼致しました。

  有難う御座いました。

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  遺伝子診断治療開発研究部　　
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  ----- Original Message ----- 
  From: "Itoshi NIKAIDO" <itosh****@nifty*****>
  To: "Knobユーザの情報交換のためのメーリングj%9%H" 
<knob-****@lists*****>
  Sent: Sunday, June 12, 2005 2:02 AM
  Subject: [Knob-friends 18] Re: KEGG API　使用時のエラー


  > にかいどうです。
  >
  > URLをとるなら以下のほうがいいですね。
  >
  > #!/usr/bin/env ruby
  > require 'bio'
  >
  > ecid = 'ec:1.1.1.1'
  > serv = Bio::KEGG::API.new
  > pathways = serv.get_pathways_by_enzymes(ecid)
  > pathways.each do |pathway_id|
  >   url = serv.mark_pathway_by_objects(pathway_id, ecid)
  >   p url
  > end
  >
  > On 2005/06/12, at 1:44, Itoshi NIKAIDO wrote:
  >
  >> get_pathways_by_enzymesをつかうと良いと思います。
  >> 以下にサンプルスクリプトを記述しておきますので参考に
  >> してください。
  >>
  >> #!/usr/bin/env ruby
  >> require 'bio'
  >> serv = Bio::KEGG::API.new
  >> pathways = serv.get_pathways_by_enzymes(['ec:1.1.1.1'])
  >> pathways.each do |url|
  >>    p url
  >> end
  >
  >
  >
  > --
  > 二階堂愛, Ph.D. <itosh****@saita*****> / http://itoshi.tv/
  > 埼玉医科大学  ゲノム医学研究センター  ゲノム科学部門
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[Knob-friends 20] Re: KEGG API　使用時のエラー