Itoshi NIKAIDO
itosh****@nifty*****
2005年 6月 28日 (火) 21:23:37 JST
にかいどうです。 HMMERは入っていますが、ほかのものはインストールされていません。 必要とするものがあれば、検討します。 一般的に、「こんなことにKNOBを使いたい、だから、これが必 要」という 要求だと採用されやすいです。 ちなみに、、、 EMBOSSYはEMBOSS以外の第三者が作ったプログラムを集めたもの です。 よって、EMBOSSに含める理由はありません。個別にインストール してください ということです。 ただ、EMBOSSのいくつかのプログラムがこれらの第三者のプログ ラムを 必要とするので、ライセンスに問題のないものは再配布しているという ことです。 このへんのことは JAMBO か EMBOSS のメーリングリストで 聞いてください。 On 2005/06/28, at 15:53, Nagano wrote: > KNOBには、EMBOSSがインストールされていますが、 > EMBOSSのパッケージに収録されていないソフトで「EMBASSY」 > と言う項目があり、これに含まれるソフトはKNOBにはインス > トールされて居ないようですが、今後載せられる予定はありますで > しょうか。。 > > また「EMBASSY」はどういう位置づけでEMBOSSに一体 > 化していないのでしょうか。Webで見る限りでは、ライセンス > や開発者の意向でEMBOSSと別にした、と言う事の様ですが。 > > EMBASSYに分類されている、PHYLIP, PHYLIPNEW, DOMAINATRIX, > DOMALIGN, > DOMSEARCH, HMMER etc は、必要なら個別にインストールせよと言う > 事でしょうか。それならばEMBASSYとして態々分類して表示す > る必要性が不明なのですが何故でしょうか。それともEMBOSSの > ライブラリや外部DBとの連携も出来る様なインストールを > （EMBOSS同様のConfigureで）すればEMBOSSと一 > 体化した仕様に自分でカスタマイズできる事を示しているのでしょう > か。 > > Jambo-UsersやEMBOSSのメーリングリストに投げるべき質問 > かも知れませんが、宜しくコメント頂けましたら幸いです。
