Itoshi NIKAIDO
itosh****@nifty*****
2005年 6月 29日 (水) 17:34:43 JST
にかいどうです。 以下のソフトのなかで、再配布可能なものは検討してみます。 基本的に再配布可能なライセンスのものしかKNOBには いれられません。よって、phred/phrap/conse, PolyPhredは収録することはありません。 KNOBの大変なところは、リマスタ後のテストとライセンス の調査です。ライセンスの調査が終わっていてインストールの 方法が明らかなソフトから取り込んでいるというのが現状です。 On 2005/06/29, at 17:09, Nagano wrote: > SNP同定； PolyPhred, phred/phrap/consed > 遺伝統計解析； ARLEQUIN > 遺伝子コード領域予測； Genescan 、Wise2 > 転写因子結合領域抽出； transfac > モチーフ配列検出； MEME/MAST > 系統樹作成； PHYLIP(orPHYLIPNEW)、TreeView >> このへんのことは JAMBO か EMBOSS のメーリングリス >> トで >> 聞いてください。 > > 了解致しました。ただEMBASSYに関する記載（過去ログ）が > 余り見つけられなかったのが現状でこちらに御連絡させて頂いた経緯 > もあります。 それぞれのソフトの使い方や原理、歴史、XXXってなに、 といった質問は、よりふさわしいところで聞いたほうが答えが得られや すのでは、という意味です。 KNOBにこれが入ってないよ、とか、いれてほしいという要望や はいってるのに動いてないよ、という指摘なども歓迎です。
