Nagano
nagano_imcj****@syd*****
2005年 6月 29日 (水) 17:49:00 JST
二階堂さん 長野です お返事有難う御座います。 > 以下のソフトのなかで、再配布可能なものは検討してみます。 宜しく御検討頂けます様お願い申し上げます。 > 基本的に再配布可能なライセンスのものしかKNOBには > いれられません。よって、phred/phrap/conse, > PolyPhredは収録することはありません。 良く分かりました。個人ユーズで組み込むなりリマスタするなど出来ればと考えております。 > KNOBの大変なところは、リマスタ後のテストとライセンス > の調査です。ライセンスの調査が終わっていてインストールの > 方法が明らかなソフトから取り込んでいるというのが現状です。 公に配布する場合の検討部分を考慮した事が余りないため、思いの至らない部分もあり失礼致しました。 KNOBが目指す・意図する利便性を考えると、初期設定に非常に膨大な時間を費やした事が嘘の様で、すぐに実際のトライアルに入れ、自分用のカスタマイズもベースに加える形で出来る事を考えると私は非常に大きな恩恵に与っております。出来れば今後先のメールに記載した事項だけでなく自己開発したオープンできるソースなども盛り込むなどしてKNOBに寄与できる部分が出来たらと考えております。 --------------------------------- 〒162-8655 東京都新宿区戸山1-21-1 国立国際医療センター研究所 遺伝子診断治療開発研究部 長野 忍 03-3202-7181(内線；2830) nagano_imcj****@syd***** --------------------------------- ----- Original Message ----- From: "Itoshi NIKAIDO" <itosh****@nifty*****> To: "Knobユーザの情報交換のためのメーリングj%9%H" <knob-****@lists*****> Sent: Wednesday, June 29, 2005 5:34 PM Subject: [Knob-friends 30] Re: EMBASSYに関して > にかいどうです。 > > 以下のソフトのなかで、再配布可能なものは検討してみます。 > > 基本的に再配布可能なライセンスのものしかKNOBには > いれられません。よって、phred/phrap/conse, > PolyPhredは収録することはありません。 > > KNOBの大変なところは、リマスタ後のテストとライセンス > の調査です。ライセンスの調査が終わっていてインストールの > 方法が明らかなソフトから取り込んでいるというのが現状です。 > > On 2005/06/29, at 17:09, Nagano wrote: > >> SNP同定； PolyPhred, phred/phrap/consed >> 遺伝統計解析； ARLEQUIN >> 遺伝子コード領域予測； Genescan 、Wise2 >> 転写因子結合領域抽出； transfac >> モチーフ配列検出； MEME/MAST >> 系統樹作成； PHYLIP(orPHYLIPNEW)、TreeView > >>> このへんのことは JAMBO か EMBOSS のメーリングリス >>> トで >>> 聞いてください。 >> >> 了解致しました。ただEMBASSYに関する記載（過去ログ）が >> 余り見つけられなかったのが現状でこちらに御連絡させて頂いた経緯 >> もあります。 > > それぞれのソフトの使い方や原理、歴史、XXXってなに、 > といった質問は、よりふさわしいところで聞いたほうが答えが得られや > すのでは、という意味です。 > > KNOBにこれが入ってないよ、とか、いれてほしいという要望や > はいってるのに動いてないよ、という指摘なども歓迎です。 > > > _______________________________________________ > Knob-friends mailing list > Knob-****@lists***** > http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-friends
