Nagano
nagano_imcj****@syd*****
2006年 10月 6日 (金) 16:16:33 JST
二階堂さん 長野です 新バージョン公開有難う御座います。お疲れ様です。 さて、忙しくて使用後のコメントが遅くなってしまったのですが、1.3.2では加えられた clustalwが、2.0.0.では入っていない様ですが如何でしょうか? コマンドラインで実行しても怒られるし、該当する実行ファイルを関連するライブラリで 検索して見ましたがやはり見つけられられませんでした。 上記状況に関してコメント頂けたら幸いです。 ----- Original Message ----- From: "Itoshi NIKAIDO" <drito****@gmail*****> To: <bioin****@yahoo*****>; <infob****@kazus*****>; "Knobユーザの情報交換のためのメーリングj%9%H" <knob-****@lists*****>; "knob 開発者向けメー リングリスト" <knob-****@lists*****>; <open-****@lists*****>; <knopp****@freem*****> Sent: Wednesday, July 19, 2006 9:52 PM Subject: [Knob-friends 68] KNOB 2.0.0リリース > にかいどうです. > > バイオインフォマティクス向け Live CD Linux であるKNOB 2.0.0 > をリリースしました. > > 主な変更点は以下の通りです. > > -Knoppix 4.x系にアップグレード > -起動の高速化 > -Javaが搭載された > -Tavernaを搭載したため, 簡単にワークフローによる解析が可能になった. > -高速化ツールキット "LCAT"により起動時間が5倍速くなった. > -ゲノムデータへのアクセスができるようになった > --BioRubyのBio::Ensembl によってゲノム配列の取得が容易になった. > --Taverna の biomart pluginによって, Ensembl mart にアクセスできるようになった. > -ChemRubyを収録した. > -Intel Mac での動作を確認した. > -Intel Mac と Parallels Desktop for Macの組み合わせでの起動を確認した. > -emboss.defalutの GENBANKNをGENBANKに変更 > -その他, パッケージのバージョンアップ > > パッケージリストなどは以下からご覧下さい. > http://knob.sourceforge.jp/ja/index.php?KNOB2.0.0 > > 今回のリリースから KNOB Project への参加者が増えました. > 今回のリリースに主な貢献をした参加者を挙げておきます. > > 二階堂 愛 (KNOB Project Leader) > RIKEN CDB/Saitama Medical University > > 山本 剛とゆかいな仲間たち > 富士通SSL > > 池 泰弘 > うさぴょんソフトウエア製作所 > > プロジェクトへの参加については, 以下をご覧下さい. > > あなたができるKNOB Project への9つの貢献 > http://knob.sourceforge.jp/ja/index.php?ContributingToKnobProject > > -- > Itoshi NIKAIDO, Ph.D. > FF20 8296 ED6F D9E5 7D05 8A0F 65D8 C2F5 C8D7 2CE2 > _______________________________________________ > Knob-friends mailing list > Knob-****@lists***** > http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-friends >