[Knob-friends 69] Re: KNOB 2.0.0リリース

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Nagano nagano_imcj****@syd*****
2006年 10月 6日 (金) 16:16:33 JST


二階堂さん

長野です

新バージョン公開有難う御座います。お疲れ様です。

さて、忙しくて使用後のコメントが遅くなってしまったのですが、1.3.2では加えられた
clustalwが、2.0.0.では入っていない様ですが如何でしょうか?

コマンドラインで実行しても怒られるし、該当する実行ファイルを関連するライブラリで
検索して見ましたがやはり見つけられられませんでした。

上記状況に関してコメント頂けたら幸いです。


----- Original Message ----- 
From: "Itoshi NIKAIDO" <drito****@gmail*****>
To: <bioin****@yahoo*****>; <infob****@kazus*****>; "Knobユーザの情報交換のためのメーリングj%9%H" <knob-****@lists*****>; "knob 開発者向けメー 
リングリスト" <knob-****@lists*****>; 
<open-****@lists*****>; <knopp****@freem*****>
Sent: Wednesday, July 19, 2006 9:52 PM
Subject: [Knob-friends 68] KNOB 2.0.0リリース


> にかいどうです.
>
> バイオインフォマティクス向け Live CD Linux であるKNOB 2.0.0
> をリリースしました.
>
> 主な変更点は以下の通りです.
>
> -Knoppix 4.x系にアップグレード
> -起動の高速化
> -Javaが搭載された
> -Tavernaを搭載したため, 簡単にワークフローによる解析が可能になった.
> -高速化ツールキット "LCAT"により起動時間が5倍速くなった.
> -ゲノムデータへのアクセスができるようになった
> --BioRubyのBio::Ensembl によってゲノム配列の取得が容易になった.
> --Taverna の biomart pluginによって, Ensembl mart にアクセスできるようになった.
> -ChemRubyを収録した.
> -Intel Mac での動作を確認した.
> -Intel Mac と Parallels Desktop for Macの組み合わせでの起動を確認した.
> -emboss.defalutの GENBANKNをGENBANKに変更
> -その他, パッケージのバージョンアップ
>
> パッケージリストなどは以下からご覧下さい.
> http://knob.sourceforge.jp/ja/index.php?KNOB2.0.0
>
> 今回のリリースから KNOB Project への参加者が増えました.
> 今回のリリースに主な貢献をした参加者を挙げておきます.
>
> 二階堂 愛 (KNOB Project Leader)
> RIKEN CDB/Saitama Medical University
>
> 山本 剛とゆかいな仲間たち
> 富士通SSL
>
> 池 泰弘
> うさぴょんソフトウエア製作所
>
> プロジェクトへの参加については, 以下をご覧下さい.
>
> あなたができるKNOB Project への9つの貢献
> http://knob.sourceforge.jp/ja/index.php?ContributingToKnobProject
>
> -- 
> Itoshi NIKAIDO, Ph.D.
> FF20 8296 ED6F D9E5 7D05  8A0F 65D8 C2F5 C8D7 2CE2
> _______________________________________________
> Knob-friends mailing list
> Knob-****@lists*****
> http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-friends
> 




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