BLASTの設定ファイルの記述 (Knob-friends 73) - KNOB

二階堂さん

長野です。お世話になります。

BLASTを使用する際に、以下の２種類の初期（共通）設定及び環境設定する必要があると思います。

１；初期（共通）設定

ファイル名；「.ncbirc」　
記載内容；　[NCBI]
                 Data="/usr/local/blast/data/"
                 [BLAST]
                 BLASTDB="/usr/local/blast/db/"

２；環境（パラメータ）設定

ファイル名；「.cshrc」　
記載内容；  [BLAST]
                 BLASTMAT="/usr/local/blast/matrix"
                 BLASTFILTER="/usr/local/blast/filter"

knobのシステム構成では、上記ファイルは存在しますか？また、あればそのパスをお教え下さい。もし無い場合は、自分で自由にディレクトリをこしらえてパスを切れば良いとは思いますが既存の設定を知る必要があり、お問い合わせさせて頂きました。

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Shinobu Nagano
nagano_imcj****@syd*****
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KNOB

[Knob-friends 73] BLASTの設定ファイルの記述