[Knob-friends 75] Re: BLASTの設定ファイルの記述

Back to archive index

Itoshi NIKAIDO drito****@gmail*****
2006年 10月 21日 (土) 23:28:36 JST


長野さん

にかいどうです.

設定ファイルは作っていません.
あったほうが親切かもしれませんね.次回検討してみます.

On 10/21/06, Nagano <nagano_imcj****@syd*****> wrote:
> 二階堂さん
>
> 長野です。お世話になります。
>
> BLASTを使用する際に、以下の2種類の初期(共通)設定及び環境設定する必要があると思います。
>
> 1;初期(共通)設定
>
> ファイル名;「.ncbirc」
> 記載内容; [NCBI]
>                  Data="/usr/local/blast/data/"
>                  [BLAST]
>                  BLASTDB="/usr/local/blast/db/"
>
> 2;環境(パラメータ)設定
>
> ファイル名;「.cshrc」
> 記載内容;  [BLAST]
>                  BLASTMAT="/usr/local/blast/matrix"
>                  BLASTFILTER="/usr/local/blast/filter"
>
> knobのシステム構成では、上記ファイルは存在しますか?また、あればそのパスをお教え下さい。もし無い場合は、自分で自由にディレクトリをこしらえてパスを切れば良いとは思いますが既存の設定を知る必要があり、お問い合わせさせて頂きました。
>
> ------------------------------------
> Shinobu Nagano
> nagano_imcj****@syd*****
> ------------------------------------
>
> _______________________________________________
> Knob-friends mailing list
> Knob-****@lists*****
> http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-friends
>


-- 
Itoshi NIKAIDO, Ph.D.
FF20 8296 ED6F D9E5 7D05  8A0F 65D8 C2F5 C8D7 2CE2



Knob-friends メーリングリストの案内
Back to archive index