Go Yamamoto
gyama****@ssl*****
2006年 10月 23日 (月) 10:17:42 JST
長野様 山本と申します。はじめまして。 Nagano wrote: > > ＢＬＡＳＴで相同性検索する為、ＵｎｉＰｒｏｔに登録されている全たんぱく質のアミノ酸配列から自分でデータベースを用意する処理を行いました。 > > ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/ > > 圧縮された「uniprot_sprot.fasta.gz」（３６．２Ｍｂ）をダウンロードして、解凍しようとすると解凍できないとワーニングがでました。調べて見ると展開する容量が大きい為解凍出来ないようです。 こちらでも試してみました。 ●ダウンロード直後の状態(zが切れていますが圧縮状態です) knoppix ＠ 2[knoppix]$ pwd /home/knoppix knoppix ＠ 2[knoppix]$ ls -la : -rw-r--r-- 1 knoppix knoppix 38016140 2006-10-13 17:45 uniprot_sprot.fasta.g ●展開コマンド knoppix ＠ 2[knoppix]$ gzip -d uniprot_sprot.fasta.gz ●展開後の状態 knoppix ＠ 2[knoppix]$ ls -la : -rw-r--r-- 1 knoppix knoppix 108776481 2006-10-13 17:45 uniprot_sprot.fasta こちらでは展開はできているようです。 > 保存用のイメージファイルのサイズが小さいからかもしれないと１Ｇ近くに拡張しても解消しませんでした。 > > どの様に対応すれば処理が出来るのでしょうか。お返事頂ければ幸いです。 解凍できない、というワーニングと、それについてお調べになった点、 お使いの保存用のイメージファイルの状態などについて、お示し いただければ、またどなたか知恵を出していただけるのではないかと 思います。 -- 山本 剛(ごう) E-mail: gyama****@ssl*****
