[Knob-friends 85] Re: KNOBの使用方法に関して

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Go Yamamoto go50****@jp*****
2010年 12月 20日 (月) 09:19:59 JST


はじめまして、山本と申します。

KNOB をお使いいただき、どうもありがとうございます。

(2010/12/20 8:12), takayuki serizawa wrote:
> そのなかで、ChemRubyを利用したいのですが
> KNOBのシェル(画面のようなマークから立ち上げるもの)上に本書に記載してあるようなコマンドを打ってもエラーになってしまいます。
> KNOBのシェル上に
> #! /usr/bin ,,,,,以下にある文書を打つのは間違いなのでしょうか。

例えば、オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス p.167 の例ですと、
#! /usr .. で始まる囲みの部分は、calc_logp.rb というファイルの
内容になります。このファイルは ChemRuby の実行内容を記述しています。

その下の囲みの $ ruby calc_logp.rb ... が、calc_logp.rb を実際に
実行するコマンドになります。

> KNOBにはRubyというものが別にありこちらはまた別のシェルが立ち上がるようなのですが
> どのようにするとChemRubyが使えるのでしょうか。

Chem Ruby は Ruby のシェルを介して実行されていて、
#! /usr/bin/env ruby の行が、Ruby のシェルにより実行するという
指示になります。

その後の require 以下の部分が、Chem Ruby を使用することを示していて、
calc_logp.rb ファイルが Chem Ruby の実行内容の記述となっています。

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