takayuki serizawa
serit****@gmail*****
2010年 12月 20日 (月) 22:49:04 JST
山本様 お忙しい中返信ありがとうございます。 下記のアドバイスありがとうございます。 おっしゃるとおりにP１６７についてコンソール上で テキストと同じく $ ruby calc_logp.rb /home/knoppix/book/chapter6/troglitazone.mol と打ってみたのですが ruby: No such file or directory -- calc_logp.rb となってしまいます。 実際のファイルがおいてあったアドレスが /ramdisk/home/knoppix/book/chapter6/troglitazone.mol になっているので $ ruby calc_logp.rb /ramdisk/home/knoppix/book/chapter6/troglitazone.mol としてみても改善しませんでした。 現在KNOBはVMware Player を利用しているのですがこれが原因でしょうか。 お手数をおかけしますがよろしくご教示ください。 2010年12月20日9:19 Go Yamamoto <go50****@jp*****>: > はじめまして、山本と申します。 > > KNOB をお使いいただき、どうもありがとうございます。 > > (2010/12/20 8:12), takayuki serizawa wrote: > > そのなかで、ChemRubyを利用したいのですが > > KNOBのシェル（画面のようなマークから立ち上げるもの）上に本書に記載してあるようなコマンドを打ってもエラーになってしまいます。 > > KNOBのシェル上に > > #! /usr/bin ,,,,,以下にある文書を打つのは間違いなのでしょうか。 > > 例えば、オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス p.167 の例ですと、 > #! /usr .. で始まる囲みの部分は、calc_logp.rb というファイルの > 内容になります。このファイルは ChemRuby の実行内容を記述しています。 > > その下の囲みの $ ruby calc_logp.rb ... が、calc_logp.rb を実際に > 実行するコマンドになります。 > > > KNOBにはRubyというものが別にありこちらはまた別のシェルが立ち上がるようなのですが > > どのようにするとChemRubyが使えるのでしょうか。 > > Chem Ruby は Ruby のシェルを介して実行されていて、 > #! /usr/bin/env ruby の行が、Ruby のシェルにより実行するという > 指示になります。 > > その後の require 以下の部分が、Chem Ruby を使用することを示していて、 > calc_logp.rb ファイルが Chem Ruby の実行内容の記述となっています。 > > -- > 山本 剛(ごう) E-mail: go50****@jp***** > 富士通SSL 第二産業流通ビジネス本部 第一システム部 > Tel: 044-739-1554 Toll-Dial: 7166-5669 > ※内線番号が変わりました。 > > _______________________________________________ > Knob-friends mailing list > Knob-****@lists***** > http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-friends > -------------- next part -------------- HTMLの添付ファイルを保管しました...Download