= Mass++について Mass++ は 2006 年から 2014 年まで国の助成を得て開発が進められてきた質量分析ソフトウェアです。 2015年 3 月にソースコードが公開され、同年6月に発足した [http://www.mspp.ninja/?page_id=38 Mass++ ユーザ会] により開発・保守がなされています。 Mass++ は、データの読込・表示や解析処理を開発するための基盤となるコアライブラリと、 個々のデータ処理機能を担うプラグインで構成されています。 プラグインの開発は容易で、新たな質量分析アプリケーションやデータ解析アルゴリズムの 開発・評価を手軽に進めることを可能とします。 == 機能概要 [ソフトウエア構成] == インストール方法 1. [https://osdn.jp/projects/mspp/releases/p14652 OSDN のダウンロードサイト]から Mass++ インストーラーをダウンロードして、インストールしてください。 1. X!Tandem および MassGlycan プラグインを利用される方は、MassppProteomeDatabase1_4_0.exe を島津製作所の [http://www.shimadzu.co.jp/aboutus/ms_r/masspp.html Mass++ (V2.7.4) のダウンロードサイト]よりダウンロードして、インストールしてください。 == ビルド方法 [依存ライブラリ] = About Mass++ Mass++ is MS data analysis software funded by CREST (Core Research for Evolutional Science and Technology, Japan) and FIRST (Funding Program for World-Leading Innovative R&D on Science and Technology, Japan) since 2006 to 2013. Now, almost sources of Mass++ is distributed under open-source license(3-clause BSD license). This open-source edition of Mass++ is developed and maintained by [http://www.mspp.ninja/?lang=en_us Mass++ Users' Group, Japan]. Mass++ is plug-in based software which comprises core-libraries to provide basic functionaltiies for MS data IO, visualization and analysis, and plug-ins for each data processings. It is easy to add novel fucntionalities into Mass++ as plug-ins. == Overview === Feature [Feature] == Installation 1. Download Mass++ installer for Windows from [https://osdn.jp/projects/mspp/releases/p14652 here], and install it. 1. Download database installer, MassppProteomeDatabase1_4_0.exe, to use X!Tandem or MassGlycan plug-in from [http://www.shimadzu.co.jp/aboutus/ms_r/masspp.html Mass++ (V2.7.4) download site at Shimadzu Corp., Japan], and install it. == Building Software [DependentLibraries] === Citation 1. Mass++: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24965016 S. Tanaka et. al., Mass++: A Visualization and Analysis Tool for Mass Spectrometry, J. Proteome. Res., 2014, 13 (8), pp 3846–3853] 1. AB3D Plug-in: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25712693 K. Aoshima, et. al., A simple peak detection and label-free quantitation algorithm for chromatography-mass spectrometry, BMC Bioinformatics. 2014; 15(1): 376.] 1. Glycan Analysis Plug-in: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25712693 K. Morimoto, et. al., GlycanAnalysis Plug-in: a database search tool for N-glycan structures using mass spectrometry, Bioinformatics. 2015 Feb 23. pii: btv110] == Current Releases for Users and Tickets for Developers [[ReleaseList]] [[RecentTickets(limit=5)]]
Fork
edit