Chemistry Development Kit(CDK)は、バイオ/ケモインフォマティクスおよび計算化学の為のJavaライブラリです。JChemPaint, SENECA, NMRShiftDBのようなプロジェクトで利用され、その他にも多くのプロジェクトで使用されます。
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発表された文献のための科学的知識管理システム
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帽子 (腫瘍シーケンスのハプロタイプ増幅) は、対立遺伝子の増幅とこうして増幅ハプロタイプ次世代シーケンサーの腫瘍データ コピー数異常地域で呼び出すツールです。増幅ハプロタイプ遺伝子変異を明らかにするかもしれない。
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ATGC はヌクレオチド シーケンスを整列させるためのユーザーフレンドリーなインターフェイスで有用なアルゴリズムのパックを含むアプリケーション ドッキング コンティグようにアミノ酸配列を予測コンセンサスと制限のサイトを検索します。
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Eclipse Rich Client Platform (RCP)上に構築された、情報計算化学生物のためのオープンソース ワークベンチ。
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!BioWeka プロジェクトの目的は学習フレームワーク Weka 人気のあるマシンに例えば線形などの生物情報学の機能を追加します。
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openModeller は種の潜在的な分布のモデル化のための完全な C++ フレームワークです。また、プロジェクトには Python にはグラフィカル ユーザー インターフェイス、web サービス インターフェイスおよび API が含まれています。
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ゲノムのコンテキストで SNPs を表示する全ゲノム解析で使用する Java アプリケーション。補足データをその場でさまざまなパブリック データ ソースからダウンロードされ、キャッシュにローカルに保存されます。カスタム データは補足のトラックとして追加できます。
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計算モデルの開発とシミュレーションの環境癌システム生物学。ELECANS は、マルチ エージェント シミュレーション ツールは、組織の様々 な腫瘍のコンピュータモデ リングでは、芸術の状態です。
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AWclust は、GUI インターフェイスを持つ R の書かれた使いやすい非パラメトリック人口構造解析ソフトウェアです。ちょうどポイントし、クリックして、あなたの方法にある SNP データ セットで重要なクラスター情報を発見します。
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エラー補正 pyrosequenced 増幅を読み取ります。
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軽量 OpenGL ベースのインタラクティブなサム/BAM ビューアー。迅速かつ簡単にカバレッジ、極性、マイナーな対立遺伝子の周波数のようなサム/BAM ファイルから統計を生成し、スクロールし、自由に基づく簡単なマウス インターフェイスを探索します。複数のウィンドウを比較のために注意してください複数実験間で同期できます。
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!OptFlux は、フィールドで参照計算アプリケーションを目指し、オープン ソースとモジュール式ソフトウェアです。代謝工学標的の同定などをひずみ最適化タスクを組み込む最初のツールです。
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RNAi 高コンテンツのスクリーニングのための iBRAIN2 ソフトウェア システムは、自動分析とカスタマイズ可能なデータ管理を統合します。堅牢かつ複雑な並列コンピューター クラスター インフラストラクチャができ主と結果のデータ セットの信頼性の高いストレージすることができます。
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クケリは終了またはドラフト シーケンスの急速な全ゲノム ・ アラインメントのモジュラー システムです。このパッケージには、効率的なサフィックス ツリー ライブラリ、seed 拡張整列、SNP 検出、繰り返し検出と可視化ツールを提供します。
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