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!RasTop は蛋白質、核酸、人気 Rasmol ソフトウェアに基づいて小分子の可視化分子グラフィック プログラムです。プログラムは、急速な可視化と分子の解析を目指しています。

MZmine 2 は Java で書かれた質量分析データの差分解析フレームワークです。

!PyRx は、潜在的な創薬ターゲットに対する化合物のスクリーン ライブラリを使用することができます計算の薬剤の発見のための仮想スクリーニング ソフトウェアです。!PyRx 有効に薬効がある化学者を任意のプラットフォームから仮想スクリーニングを実行してデータの準備ジョブの送信と結果の分析から - このプロセスの各ステップでユーザーに役立ちます。それは魔法のボタンある創プロセスでない場合は true ですが、!PyRx にはドッキング ウィザードとそれにコンピューター支援薬物設計のための貴重なツールを使いやすいユーザー インターフェイスが含まれます。!PyRx にはまた化学のスプレッドシートのような機能と合理的な薬剤設計に不可欠な強力な可視化エンジンが含まれています。!PyRx ホーム ページ !PyRx や動画を見るそれを使用する方法についての詳細を学ぶために訪問してください。

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール （経口毒性） - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

Mac osx 版、もう os9 をサポートしていない Lepard にアップグレードします。このプロジェクトはビルド DNA ストライダー飛竜のヘルプをユーザーが自分のデータを取得し、いくつかの基本的な DNA の実行を分析関数。

（ジャワ） における次世代シーケンシング形式のデータを BAM (http://samtools.sourceforge.net) を扱うためのツールのセットです。

ERmod （エネルギー表現モジュール） は、エネルギー表示法による溶媒和自由エネルギーを計算するためのプログラム (j. 化学物理 113、6070 (2000))。プログラムは、不均一系を含む、任意の溶剤の溶媒和自由エネルギーを計算することができる、NAMD、GROMACS やオレンジなどの最先端の分子シミュレーション ソフトウェアとの連携で実行することができます。