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50 projects in result set
LastUpdate: 2007-09-26 00:09

RasTop

!RasTop は蛋白質、核酸、人気 Rasmol ソフトウェアに基づいて小分子の可視化分子グラフィック プログラムです。プログラムは、急速な可視化と分子の解析を目指しています。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2019-08-17 21:06

Molby - A Molecular Modeling Software

Molby is a software for building molecular models on the graphic screen. It works on Mac OS X and Windows. It can import and export files for other computational chemistry softwares such as GAMESS and Gaussian. It can also edit molecules by script...

Development Status: 5 - Production/Stable
Target Users: Science/Research
Natural Language: English, Japanese
Operating System: MacOSX, Windows XP
Programming Language: C, C++, Ruby
User Interface: wxWidgets
Register Date: 2010-01-21 01:18
LastUpdate: 2017-10-28 12:33

APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

LastUpdate: 2009-05-11 22:56

ISPyB

高分子(タンパク質)結晶のX線実験のためのWebベースの情報管理システムです。

Database Environment: MySQL
Development Status: 5 - Production/Stable
Target Users: Science/Research
Natural Language: English
Programming Language: Java
User Interface: Web Environment
LastUpdate: 2019-07-06 10:26

Bowtie

Bowtieは、次世代シーケンサーから短いDNA配列(の読み取り)のための超高速でメモリ効率の良いリードアライナです。

LastUpdate: 2016-12-03 05:56

Avogadro

Avogadroは、計算化学、分子モデリング、バイオインフォマティクス、材料科学、およびそれらの関連分野で使用するための高度でクロスプラットフォームな分子エディタです。柔軟なレンダリングのフレームワークと強力なプラグインアーキテクチャを提供しています。

LastUpdate: 2015-04-03 10:58

MZmine 2

MZmine 2 は Java で書かれた質量分析データの差分解析フレームワークです。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2016-01-17 11:42

PyRx - Virtual Screening Tool

!PyRx は、潜在的な創薬ターゲットに対する化合物のスクリーン ライブラリを使用することができます計算の薬剤の発見のための仮想スクリーニング ソフトウェアです。!PyRx 有効に薬効がある化学者を任意のプラットフォームから仮想スクリーニングを実行してデータの準備ジョブの送信と結果の分析から - このプロセスの各ステップでユーザーに役立ちます。それは魔法のボタンある創プロセスでない場合は true ですが、!PyRx にはドッキング ウィザードとそれにコンピューター支援薬物設計のための貴重なツールを使いやすいユーザー インターフェイスが含まれます。!PyRx にはまた化学のスプレッドシートのような機能と合理的な薬剤設計に不可欠な強力な可視化エンジンが含まれています。!PyRx ホーム ページ !PyRx や動画を見るそれを使用する方法についての詳細を学ぶために訪問してください。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2017-07-11 03:53

Gabedit

Gabeditは、Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, Mopac2007, Orca, PC Gamess, そして Q-Chemといった計算化学パッケージのためのグラフィカルユーザーインターフェイスです。

LastUpdate: 2018-05-04 23:51

Toxtree: Toxic Hazard Estimation

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2018-06-14 01:12

LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

LastUpdate: 2009-04-14 10:21

DNAStrider

Mac osx 版、もう os9 をサポートしていない Lepard にアップグレードします。このプロジェクトはビルド DNA ストライダー飛竜のヘルプをユーザーが自分のデータを取得し、いくつかの基本的な DNA の実行を分析関数。

(Machine Translation)
Database Environment: SQLite
Development Status: 3 - Alpha
Natural Language: English
Operating System: MacOSX, Linux, Windows XP
Programming Language: REALbasic
LastUpdate: 2014-08-26 05:14

picard

(ジャワ) における次世代シーケンシング形式のデータを BAM (http://samtools.sourceforge.net) を扱うためのツールのセットです。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2019-06-28 10:34

ERmod

ERmod (エネルギー表現モジュール) は、エネルギー表示法による溶媒和自由エネルギーを計算するためのプログラム (j. 化学物理 113、6070 (2000))。プログラムは、不均一系を含む、任意の溶剤の溶媒和自由エネルギーを計算することができる、NAMD、GROMACS やオレンジなどの最先端の分子シミュレーション ソフトウェアとの連携で実行することができます。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2015-03-07 05:42

SketchEl

様々なケムインフォマティクスアプリケーションで使用するための化学構造のスケッチツールです。MDL MOLファイルの作成と編集に適しています。