Takuo Yasunaga
yasun****@bio*****
2015年 3月 2日 (月) 18:34:20 JST
木下さん 安永です。 下記、有難うございました。 ノイズがずいぶん大目なので、無理があるかもしれません。 LowPassFilter以外だと、Medianフィルタ(mrcImageSmoothing)辺りが一つの候補 です。 また、今、LowPassFilterは、expを使っていますか？それともGaussを使ってい ますか？ GaussのほうがしっかりとLowPassが掛かります。 以上です。 On 2015/03/02 17:53, Teppei Kinoshita wrote: > eos-documentメンバー各位 > > 木下 哲平です。お世話になっております。 > 本日、3月2日(月)のEospedia編集内容を報告致します。 > > 【活動項目】 > (1) PIONEチュートリアル > (1-1) クラスター解析 > (1-1-1) Makefile用のパラメータをPIONEで設定できるようにする > ・パラメータ追加時にパラメータ宣言とシーケンスへの登録だけで済むように実装 > （書き込み処理に新たに処理を追加する必要がなくなりました） > > (2) クラスター解析 > (2-1) SN比が悪い（0.3 ~ 0.5程度）場合の前処理 > 現チュートリアルの入力ファイルからSN比のみを変更した画像にて、前処理後に分類できるかを考えます > ・サイズ32×32 > ・角度（非面内回転4種×面内回転10種） > > (2-1-1) mrcImageLowPassFilterの-hvpを段々落としてみる > -> 0.1 から 0.03(0.01刻み)まで試しましたが、分類できませんでした。 > > (2-1-2) mrcImageLowPassFilter以外の手法を考える > -> Eosのコマンドより模索します > > (3) API説明 > ・lmrcFETnormalizeBySD(API) +3 > > 【現在の編集状況と今後の予定(優先降順)】 > チュートリアル: クラスター解析にて前処理の方法を考える > PIONEチュートリアル, TIPS: PIONEのメソッド一覧の使用例を挙げる > PIONE-Webclient: 新しい操作説明となる場合に実行例を追記する > API説明: 715件 > 英語化: メインページ周り > FAQ: 随時追記 > > 【次回の予定】 > クラスター解析の前処理にてフィルタリングの方法を考えます。 > > 以上、よろしくお願いします。 > > 木下 哲平 > -- Takuo Yasunaga Kyushu Institute of Technology 680-4 Kawazu, Iizuka, Fukuoka, 820-8502, JAPAN
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