Fess 4.1 は Java 6u21 以上の環境が必要になります (parseDouble問題もあるので 6u24 以上を推奨します)。どうしても 6u21 未満の Java 環境でS実行しなければならない場合は bin/setenv.[sh|bat] の -XX:+UseCompressedStrings と -XX:+OptimizeStringConcat のオプションを削除してください。
Fess 4.1でサポートするJavaのバージョン