Kazuharu Arakawa
gaou****@sfc*****
2009年 3月 19日 (木) 09:54:57 JST
一点書き忘れました。
G構造体を作るときに
$gb = new G("ecoli");
$gb = load("ecoli");
配列情報を取得する時に
$gb->{SEQ}
$gb->seq()
のそれぞれ二通りありますが、Gliteでは
load, seq()の１通りずつしか使えません。
Kazuharu Arakawa, Ph.D.
Institute for Advanced Biosciences, Keio University
252-8520 Japan Tel/Fax: +81-466-47-5099
On 2009/03/19, at 9:52, Kazuharu Arakawa wrote:
> g.
>
> Bio::GliteモジュールをCPANでリリースしました。
> http://search.cpan.org/~gaou/Bio-Glite-0.01/lib/Bio/Glite.pm
>
> 既にCPANでmirrorされはじめています。
>
> 基本的に、これはGのPerlライブラリ部分の全機能を
> 使える
> モジュールですが、ほぼ全ての実行をウェブサービス経由で
> 実行するため、ソースコードは大量のドキュメントを含め
> １０００行未満（数10kb）で他のモジュールにほぼ依存せず、
> CPUもRAMも使いません。その分少しだけ動作が遅いです。
>
> というわけで、非常にlightweightなG-languageに
> なっています。
> まだ不具合もあるかと思いますが、使ってみてレポートを
> いただけると嬉しいです。
>
> この仕事はBioHackathon 2009の主な成果の一つとなってい
> ます。
> （参加者：荒川・木戸・大下）
>
>
>
>
> Kazuharu Arakawa, Ph.D.
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